28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5308 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  65 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  60.53 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  64.52 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  60.61 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  60.61 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  40.79 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  60.61 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  47.83 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  52.5 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  55.88 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  54.29 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  61.29 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  57.58 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  46.3 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  55.56 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  57.58 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.29 
 
 		 326 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3210  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  69.23 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  57.58 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>