23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1789 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  97.73 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  74.58 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  76.27 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  53.21 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  97.67 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  50.46 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  80.56 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  72.22 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  52.17 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  60.61 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  39.44 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  41.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  53.12 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  51.35 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  46.27 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  44.78 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  53.33 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  51.61 
 
 		 108 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>