26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  189  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  88.12 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  51.35 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  73.08 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  83.72 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  82.93 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  82.93 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  82.93 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  82.93 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  51.65 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  60.47 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  36.47 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  36.47 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  48 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  40.54 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  48.78 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1516  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05420  hypothetical protein  58.06 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  43.84 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  42.47 
 
 		 133 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  55.88 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>