11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1354 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  234  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2957  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  37.25 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  37.25 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  37.25 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  53.66 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1602  hypothetical protein  35.23 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117892  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  52.38 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  44.68 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  57.14 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  53.66 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>