22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6584 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  190  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  59.38 
 
 
111 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  56.1 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  40.51 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5561  hypothetical protein  43.42 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.26 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  46.34 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1222  hypothetical protein  47.62 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  48.65 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  48.72 
 
 
69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  43.9 
 
 
58 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  42.86 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  43.18 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  36.47 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1581  hypothetical protein  47.73 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>