12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1516 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  256  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0629  lipoprotein (VmcE)  49.09 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0157235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  32.22 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  44.74 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  35.71 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  34.95 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5908  hypothetical protein  63.64 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  50 
 
 		 228 aa  40  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>