11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05420 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_05420  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  47.62 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  40.38 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  55.88 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  53.33 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>