More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6447 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 318 aa  620  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.150998  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.23 
 
 		 318 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  41.46 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  33.53 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  35.35 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  35.35 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  33.14 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  34.39 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  35.67 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  34.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.19 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  35.49 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  38.59 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.53 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  34.71 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  34.71 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  34.71 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.63 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  32.54 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.65 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.53 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.54 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.14 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.37 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  32.7 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.82 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  40.15 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  33.53 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  32.54 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  35.5 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  32.45 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  32.94 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>