127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0717 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0717  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4014  aldose 1-epimerase  55.39 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0559  Aldose 1-epimerase  55.19 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  33.85 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0846  hypothetical protein  37.22 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.721242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  35.86 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  32.49 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  31.92 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1264  aldose 1-epimerase-like protein  34.44 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  32.14 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 300 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23210  aldose 1-epimerase-like enzyme  33.33 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0126  Aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002907  UPF0010 protein yeaD  31.39 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0184423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  31.08 
 
 		 925 aa  92.8  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01070  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0142  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 		 298 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0934  aldose 1-epimerase  31.7 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  26.13 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  27.35 
 
 		 315 aa  85.9  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5381  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 301 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934707  normal  0.209999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  26.79 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5332  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  28.79 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2567  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0100101  hitchhiker  0.000801765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  29.44 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1588  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  28.37 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3996  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.342711  normal  0.114283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1394  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  28.98 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1722  aldose 1-epimerase  28.89 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000918038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1633  aldose 1-epimerase  28.95 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  25.56 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2697  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.459697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1725  aldose 1-epimerase  28.89 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  29.8 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2460  aldose 1-epimerase  28.7 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2139  Aldose 1-epimerase  27.57 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.931505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2388  aldose 1-epimerase  29.46 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2553  aldose 1-epimerase  28.7 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0396269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2165  aldose 1-epimerase  28 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1261  Aldose 1-epimerase  29.22 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2115  hypothetical protein  28.83 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  30.74 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2769  hypothetical protein  28.25 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  24.33 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1851  aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48620  Aldose 1-epimerase family protein  32.47 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.462655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1765  aldose 1-epimerase  28.44 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186472  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  29.39 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2109  aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39789  predicted protein  28.7 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86923  predicted protein  25.81 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01249  uncharacterized aldose 1-epimerase-like protein  25.69 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  26.15 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1615  aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0617  aldose 1-epimerase  27.23 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000473738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  24.38 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  27.73 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1915  aldose 1-epimerase  25.76 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.218875  normal  0.439365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  26.73 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  26.89 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  26.36 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  26.36 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  26.73 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  26.36 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  26.89 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  27.52 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  30.05 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  27.52 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  26.73 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  28.25 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22010  aldose 1-epimerase-like enzyme  28.45 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.877167  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1468  transglycolase; epimerase  26.27 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  26.27 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39942  predicted protein  24.81 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14410  aldose 1-epimerase-like enzyme  28.38 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  26.42 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  29.86 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2307  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17895  predicted protein  25.09 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  24.34 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>