146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39789 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_39789  predicted protein  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86923  predicted protein  48.25 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17895  predicted protein  39.87 
 
 
342 aa  205  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  34.81 
 
 
300 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  32.58 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 
287 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  35.45 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  32.45 
 
 
291 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  32.48 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  35.71 
 
 
285 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  33.85 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  31.52 
 
 
278 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1633  aldose 1-epimerase  32.47 
 
 
279 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002907  UPF0010 protein yeaD  33.21 
 
 
294 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0184423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1394  aldose 1-epimerase  31.65 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  33.83 
 
 
925 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  31.43 
 
 
296 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  32.73 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2139  Aldose 1-epimerase  33.71 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.931505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  33.07 
 
 
304 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  32.79 
 
 
720 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32562  predicted protein  30.66 
 
 
450 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170002  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
303 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  30.19 
 
 
291 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01249  uncharacterized aldose 1-epimerase-like protein  29.72 
 
 
283 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  30.9 
 
 
291 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2307  aldose 1-epimerase  30.5 
 
 
281 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  31.8 
 
 
301 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  29.35 
 
 
302 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
303 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  28.57 
 
 
307 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  28.78 
 
 
315 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  29.08 
 
 
303 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  29.2 
 
 
297 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  32.94 
 
 
294 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2109  aldose 1-epimerase  28.02 
 
 
283 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 
294 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  33.33 
 
 
294 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  32.94 
 
 
301 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2165  aldose 1-epimerase  29.79 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.6711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  32.94 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  32.55 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  32.55 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3996  Aldose 1-epimerase  28.25 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.342711  normal  0.114283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  33.2 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2697  aldose 1-epimerase  30.62 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.459697  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1722  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000918038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  30.98 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  24.3 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5332  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0846  hypothetical protein  28.63 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.721242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  29.34 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39942  predicted protein  27.57 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0142  aldose 1-epimerase  26.2 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  32.55 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1588  aldose 1-epimerase  28.72 
 
 
282 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71570  hypothetical protein  26.55 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2567  Aldose 1-epimerase  28.72 
 
 
282 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0100101  hitchhiker  0.000801765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6210  hypothetical protein  26.21 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2769  hypothetical protein  27.14 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1725  aldose 1-epimerase  28.37 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2388  aldose 1-epimerase  27.86 
 
 
282 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  28.4 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  28.92 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22010  aldose 1-epimerase-like enzyme  31.37 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.877167  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2460  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2553  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0396269  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  26.98 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0287  aldose 1-epimerase  28.22 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1468  transglycolase; epimerase  29.17 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5381  aldose 1-epimerase  26.98 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934707  normal  0.209999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1765  aldose 1-epimerase  27.14 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186472  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0559  Aldose 1-epimerase  30.25 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1615  aldose 1-epimerase  29.15 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  25.84 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48620  Aldose 1-epimerase family protein  27.2 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.462655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2115  hypothetical protein  29.79 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14410  aldose 1-epimerase-like enzyme  29.18 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  28.85 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0126  Aldose 1-epimerase  31.03 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 
294 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 
294 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 
294 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1915  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.218875  normal  0.439365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23210  aldose 1-epimerase-like enzyme  29.39 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  26.22 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0934  aldose 1-epimerase  30.04 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  25.56 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1264  aldose 1-epimerase-like protein  27.15 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1851  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  27.62 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01070  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4014  aldose 1-epimerase  27.98 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>