133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1765 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1765  aldose 1-epimerase  100 
 
 
282 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186472  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1725  aldose 1-epimerase  96.81 
 
 
282 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1722  aldose 1-epimerase  97.16 
 
 
282 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000918038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2567  Aldose 1-epimerase  96.45 
 
 
282 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0100101  hitchhiker  0.000801765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1588  aldose 1-epimerase  95.74 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2769  hypothetical protein  87.23 
 
 
282 aa  523  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2460  aldose 1-epimerase  87.59 
 
 
282 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2388  aldose 1-epimerase  86.52 
 
 
282 aa  517  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2553  aldose 1-epimerase  87.23 
 
 
282 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0396269  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2307  aldose 1-epimerase  75.09 
 
 
281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1851  aldose 1-epimerase  75.09 
 
 
281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2165  aldose 1-epimerase  73.31 
 
 
284 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.6711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2697  aldose 1-epimerase  72.24 
 
 
282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.459697  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1915  aldose 1-epimerase  71.17 
 
 
282 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.218875  normal  0.439365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2115  hypothetical protein  71.89 
 
 
281 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2109  aldose 1-epimerase  61.79 
 
 
283 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  36.59 
 
 
278 aa  211  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  35.53 
 
 
295 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0142  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 
298 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5332  aldose 1-epimerase  35.02 
 
 
298 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5381  aldose 1-epimerase  34.95 
 
 
301 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934707  normal  0.209999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  35.44 
 
 
925 aa  185  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  34.34 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1615  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 
306 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71570  hypothetical protein  35.02 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6210  hypothetical protein  35.02 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  36.36 
 
 
303 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 
299 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 
303 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48620  Aldose 1-epimerase family protein  34.67 
 
 
304 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.462655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  36.5 
 
 
291 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2139  Aldose 1-epimerase  30.8 
 
 
300 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.931505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  34.46 
 
 
291 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1394  aldose 1-epimerase  31.87 
 
 
308 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002907  UPF0010 protein yeaD  35.77 
 
 
294 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0184423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  36.82 
 
 
291 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  36.82 
 
 
291 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  36.82 
 
 
291 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  34.62 
 
 
294 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0287  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 
321 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  33.08 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  30.58 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  32.97 
 
 
301 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  32.97 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  32.97 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  32.97 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22010  aldose 1-epimerase-like enzyme  31.54 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.877167  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  32.97 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  32.97 
 
 
301 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  31 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  33.85 
 
 
296 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  32.12 
 
 
304 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  32.61 
 
 
301 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  32.25 
 
 
294 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  33.98 
 
 
294 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  33.98 
 
 
294 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  33.59 
 
 
294 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  32.69 
 
 
294 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  31.88 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  31.39 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  31 
 
 
289 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  31.95 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1261  Aldose 1-epimerase  30.63 
 
 
284 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  33.09 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  30.96 
 
 
276 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  33.73 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3996  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.342711  normal  0.114283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01249  uncharacterized aldose 1-epimerase-like protein  31.18 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1633  aldose 1-epimerase  29.12 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  28.27 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1468  transglycolase; epimerase  29.7 
 
 
281 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4365  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 
284 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0939645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  32.68 
 
 
300 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  29.96 
 
 
307 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  30.25 
 
 
282 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0126  Aldose 1-epimerase  30.71 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1155  aldose 1-epimerase  30.98 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282686  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
299 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0617  aldose 1-epimerase  32.18 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000473738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  32.14 
 
 
720 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0934  aldose 1-epimerase  29.58 
 
 
303 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  32.77 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1264  aldose 1-epimerase-like protein  27.37 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  30.08 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 
291 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
281 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1298  hypothetical protein  30.32 
 
 
291 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1118  aldose 1-epimerase  30.73 
 
 
291 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.894035  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14410  aldose 1-epimerase-like enzyme  27.51 
 
 
292 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23210  aldose 1-epimerase-like enzyme  25.58 
 
 
305 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 
278 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  29.68 
 
 
288 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  29.12 
 
 
302 aa  98.6  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4204  aldose 1-epimerase  28.14 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1020  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1018  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>