151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2504 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  98.3 
 
 
294 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  97.28 
 
 
294 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  96.94 
 
 
294 aa  593  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  97.28 
 
 
294 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  96.94 
 
 
294 aa  593  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  96.94 
 
 
301 aa  591  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  96.94 
 
 
301 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  97.28 
 
 
301 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  82.65 
 
 
294 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  82.65 
 
 
294 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  82.31 
 
 
294 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  82.65 
 
 
294 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  81.97 
 
 
294 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  72.11 
 
 
294 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  55.63 
 
 
291 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  55.29 
 
 
291 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  55.29 
 
 
291 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  57.04 
 
 
291 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  57.14 
 
 
290 aa  349  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  56.66 
 
 
289 aa  344  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  55.63 
 
 
289 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  54.08 
 
 
290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  35.45 
 
 
296 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  35.29 
 
 
294 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  36.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002907  UPF0010 protein yeaD  35.05 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0184423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  37.36 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1394  aldose 1-epimerase  35.77 
 
 
308 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  37.89 
 
 
303 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2139  Aldose 1-epimerase  34.39 
 
 
300 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.931505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  32 
 
 
301 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1615  aldose 1-epimerase  33.57 
 
 
306 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1261  Aldose 1-epimerase  37.93 
 
 
284 aa  149  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  38 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  32.97 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  33.59 
 
 
305 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2307  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 
281 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  35.34 
 
 
925 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  32.97 
 
 
303 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14410  aldose 1-epimerase-like enzyme  36 
 
 
292 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0142  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 
298 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1851  aldose 1-epimerase  31.34 
 
 
281 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  35.85 
 
 
291 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1915  aldose 1-epimerase  33.21 
 
 
282 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.218875  normal  0.439365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5332  aldose 1-epimerase  33.97 
 
 
298 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48620  Aldose 1-epimerase family protein  32.85 
 
 
304 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.462655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  33.97 
 
 
298 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  31.67 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1468  transglycolase; epimerase  32.12 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5381  aldose 1-epimerase  32.57 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934707  normal  0.209999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2109  aldose 1-epimerase  32.58 
 
 
283 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1633  aldose 1-epimerase  32.35 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  32.52 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2165  aldose 1-epimerase  34.65 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.6711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  32.05 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  32.6 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2388  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 
282 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2460  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
282 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2769  hypothetical protein  32.83 
 
 
282 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2553  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
282 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0396269  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  34.26 
 
 
282 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  38.84 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1765  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 
282 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186472  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1722  aldose 1-epimerase  32.16 
 
 
282 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000918038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2697  aldose 1-epimerase  30.8 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.459697  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2115  hypothetical protein  32.71 
 
 
281 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1725  aldose 1-epimerase  32.51 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2567  Aldose 1-epimerase  31.8 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0100101  hitchhiker  0.000801765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0617  aldose 1-epimerase  35.42 
 
 
306 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000473738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22010  aldose 1-epimerase-like enzyme  33.22 
 
 
300 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.877167  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  32.14 
 
 
720 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  32.57 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1018  aldose 1-epimerase  33.45 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550581  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1588  aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240698  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  32.53 
 
 
288 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  32.53 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  35 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1020  aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
284 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1058  aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
284 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.590363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4204  aldose 1-epimerase  32.75 
 
 
284 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  34.3 
 
 
276 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3996  Aldose 1-epimerase  32.97 
 
 
288 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.342711  normal  0.114283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  33.74 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4365  aldose 1-epimerase  31.3 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0939645  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71570  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  36.4 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6210  hypothetical protein  29.43 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  35.54 
 
 
300 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10222  possible apospory-associated protein c (AFU_orthologue; AFUA_4G08880)  35.5 
 
 
315 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000407893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1298  hypothetical protein  31.7 
 
 
291 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0126  Aldose 1-epimerase  32.68 
 
 
288 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1118  aldose 1-epimerase  31.32 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.894035  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01070  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23210  aldose 1-epimerase-like enzyme  34.54 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01249  uncharacterized aldose 1-epimerase-like protein  31.1 
 
 
283 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0846  hypothetical protein  29.39 
 
 
272 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.721242 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85423  hypothetical uncharacterized conserved protein  31.58 
 
 
302 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0569839  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  34.52 
 
 
285 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23050  hypothetical protein  27.34 
 
 
283 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>