66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0226 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  100 
 
 		 347 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  57.94 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.35 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  59.05 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.35 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.35 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.35 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  59.35 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  60.12 
 
 		 338 aa  355  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.81 
 
 		 338 aa  355  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  56.13 
 
 		 353 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.5 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  54.14 
 
 		 341 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  57.06 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  55.49 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  51.2 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  52.54 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  49.56 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  53.08 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  50.45 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  51.23 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  46.57 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  51.04 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  45.45 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  45.43 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  43.41 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  43.63 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  43.71 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  43.94 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.48 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  41.09 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  42.65 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.72 
 
 		 331 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.66 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.65 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.42 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.12 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.07 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  36.72 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.58 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.28 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  39.02 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  37.29 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  39.06 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  39.67 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  36.84 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  35.62 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.58 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  38.42 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  38.15 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.65 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.94 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.39 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  35.53 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.41 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  33.8 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  29.94 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  27.83 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  34.16 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  34.89 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  30.77 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  32.26 
 
 		 458 aa  99.4  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  26.52 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  27.03 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  22.06 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>