63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1474 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  100 
 
 		 352 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  70.45 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  54.83 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  52.12 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.12 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  46.88 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.02 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.02 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.02 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  46.02 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.57 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.53 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.58 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.74 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.17 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.17 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.29 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  44.6 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.04 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  45.27 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.75 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  42.48 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.13 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  44.31 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  40.41 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  40.52 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.15 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  37.5 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.97 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.21 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35 
 
 		 348 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  39.12 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.49 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.11 
 
 		 348 aa  167  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.86 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  38.29 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  38.55 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  35.36 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.21 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  37.82 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  32.02 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  37.24 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.39 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.44 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.56 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.52 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.87 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.86 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.01 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.81 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.16 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  27.62 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  32.13 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.14 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  31.01 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  32.04 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  33.06 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  28.87 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  26.48 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  31.42 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  36.11 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  31.08 
 
 		 408 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  31.67 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>