67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0236 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  100 
 
 		 342 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  54.74 
 
 		 342 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.69 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  50.3 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  50.45 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  48.34 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.85 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  49.85 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.85 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.55 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.85 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  51.5 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  47.99 
 
 		 353 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  49.26 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  49.69 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.56 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.85 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.26 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.39 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  52.27 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  45.48 
 
 		 347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  45.75 
 
 		 345 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  44.31 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  44.97 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  42.55 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  41.95 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  45.7 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  39.18 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  41.09 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  41.36 
 
 		 371 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.24 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.21 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  40.23 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.12 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.36 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.65 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  40 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.33 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.72 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  42.73 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  33.82 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.43 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.91 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.57 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  38.62 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.73 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.16 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  37.16 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.97 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  38.1 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.63 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.27 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.82 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  32.81 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  33.33 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  35.78 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  33.44 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  33.24 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  26.51 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  30.05 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  28.08 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  26.87 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  35.67 
 
 		 458 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  23.67 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  23.92 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  25.7 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22658  predicted protein  28 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>