65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0294 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  98.82 
 
 		 338 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  98.82 
 
 		 338 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  96.45 
 
 		 338 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  97.63 
 
 		 338 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  98.82 
 
 		 338 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  97.63 
 
 		 338 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  97.33 
 
 		 342 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  98.82 
 
 		 338 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  100 
 
 		 338 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  67.66 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  65.06 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  59.05 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  55.12 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  51.96 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  50.89 
 
 		 355 aa  311  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.54 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  48.1 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  50.29 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  50.74 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  49.26 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  50.76 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  46.67 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  46.88 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  46.33 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  42.77 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  39.05 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.37 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.46 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.65 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.5 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  38.58 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  41.39 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.05 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.06 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.05 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.61 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.79 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  36.34 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  41.62 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.24 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  36.62 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.11 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.31 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.25 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.64 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  36.68 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  35.14 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.61 
 
 		 337 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  35.82 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.86 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  35.65 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  36.06 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  34.96 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  35.45 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  31.5 
 
 		 384 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  31.33 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  32.47 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.67 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  30.61 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.84 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  34.67 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  31.94 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  35.71 
 
 		 458 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  25.87 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  24.55 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>