66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1826 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  100 
 
 
350 aa  710    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  60.93 
 
 
348 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  49.85 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  39.77 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  40.06 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  40 
 
 
343 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.48 
 
 
347 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  39.47 
 
 
337 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.14 
 
 
331 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  40.06 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.05 
 
 
344 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  35.99 
 
 
374 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.84 
 
 
348 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.14 
 
 
341 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.14 
 
 
354 aa  208  9e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.69 
 
 
348 aa  208  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  40.41 
 
 
371 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.37 
 
 
338 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.94 
 
 
338 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.37 
 
 
338 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  40.37 
 
 
338 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.37 
 
 
338 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.94 
 
 
338 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  36.7 
 
 
326 aa  205  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.2 
 
 
337 aa  205  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  40.06 
 
 
338 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.06 
 
 
342 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.81 
 
 
347 aa  205  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.53 
 
 
353 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  35.9 
 
 
349 aa  202  9e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  39.53 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  37.65 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  39.53 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.82 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.76 
 
 
347 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.94 
 
 
331 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.14 
 
 
337 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.02 
 
 
339 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.41 
 
 
342 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.69 
 
 
352 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  37.03 
 
 
355 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.08 
 
 
341 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  38.15 
 
 
352 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.43 
 
 
337 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  39.46 
 
 
345 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.3 
 
 
337 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.32 
 
 
334 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.98 
 
 
353 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  38.84 
 
 
365 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  35.12 
 
 
342 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.91 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.31 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  33.61 
 
 
384 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.32 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  32.06 
 
 
361 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  30.28 
 
 
338 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.66 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  34.63 
 
 
328 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  32.96 
 
 
372 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  33.84 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  29.97 
 
 
408 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  31.82 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  29.89 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  23.27 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  23.59 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22658  predicted protein  24.21 
 
 
405 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>