36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33152 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  100 
 
 
365 aa  741    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  41.48 
 
 
365 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01474  RNA-3'-phosphate cyclase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04640)  36.93 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880682  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  33.16 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22658  predicted protein  32.66 
 
 
405 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  26.28 
 
 
337 aa  86.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  24.92 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  26.13 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.81 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  22.51 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.26 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  25.55 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  24.12 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.86 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  21.82 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  24.1 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.33 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.57 
 
 
337 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.17 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.1 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  26.04 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  23.29 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  22.22 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  23.25 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  25.14 
 
 
372 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  23.92 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  23.26 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  21.81 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  21.76 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  23.13 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.59 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  22.45 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  24.2 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  26.37 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  22.06 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  23.87 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>