67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1458 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  100 
 
 
339 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  58.75 
 
 
337 aa  391  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  58.75 
 
 
337 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  58.16 
 
 
337 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  56.12 
 
 
338 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.62 
 
 
331 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.42 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  42.15 
 
 
331 aa  255  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  41.12 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.82 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.55 
 
 
348 aa  232  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  40.66 
 
 
348 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.86 
 
 
347 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  40.24 
 
 
337 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  38.25 
 
 
343 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.02 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.41 
 
 
334 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.43 
 
 
353 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  35.71 
 
 
328 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  37.99 
 
 
326 aa  203  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  34.62 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.02 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  33.54 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  31.34 
 
 
384 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  33.84 
 
 
350 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  31.4 
 
 
372 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  32.85 
 
 
349 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.06 
 
 
348 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  33.03 
 
 
348 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  28.49 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  32.32 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.32 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.32 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.32 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.82 
 
 
342 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.42 
 
 
338 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0886189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  32.11 
 
 
338 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.8 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.8 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  30.15 
 
 
344 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  35.35 
 
 
338 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.14 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.52 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.94 
 
 
347 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  28.53 
 
 
339 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  28.9 
 
 
374 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.67 
 
 
352 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  28.78 
 
 
341 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  27.43 
 
 
347 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.59 
 
 
342 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  28.65 
 
 
342 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  30.84 
 
 
355 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  29.6 
 
 
371 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  28.81 
 
 
371 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  29.31 
 
 
371 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  28.45 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  29.71 
 
 
408 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  28.23 
 
 
364 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  27.62 
 
 
352 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  26.87 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  28.24 
 
 
365 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.48 
 
 
341 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  34.34 
 
 
458 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  21.57 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  22.61 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  26.04 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22658  predicted protein  23.36 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>