67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1291 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1291  RNA 3'-phosphate cyclase  100 
 
 
372 aa  724    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3216  RNA 3'-phosphate cyclase  64.82 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2572  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  47.08 
 
 
339 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.728115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0003  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  42.22 
 
 
337 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.382529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0753  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  39.5 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.406999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0961  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.3 
 
 
331 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2009  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.19 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0917  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.47 
 
 
347 aa  199  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.373275  normal  0.0341505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0789  RNA 3'-phosphate cyclase  35.47 
 
 
326 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0295  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.22 
 
 
354 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00707638  normal  0.0740003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1458  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  31.4 
 
 
339 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0274  RNA-3'-phosphate cyclase  38.4 
 
 
328 aa  186  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000429102  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2210  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  38.26 
 
 
348 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0241  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.71 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1191  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.46 
 
 
341 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.826396  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1766  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.36 
 
 
331 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2158  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.07 
 
 
353 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.164943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0956  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  28.29 
 
 
337 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107873  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1672  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.53 
 
 
337 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60670  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.78 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0226  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  37.29 
 
 
347 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0217  RNA-3'-phosphate cyclase  36.42 
 
 
349 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0249  RNA 3'-phosphate cyclase  32.56 
 
 
337 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0239  RNA 3'-phosphate cyclase  38.26 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1545  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  29.12 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2696  RNA 3'-phosphate cyclase  33.82 
 
 
328 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.949797  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0600  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.19 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2819  RNA 3'-phosphate cyclase  35.52 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2836  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.39 
 
 
342 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1393  RNA 3'-phosphate cyclase  36.61 
 
 
350 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1212  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  34.9 
 
 
361 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1733  RNA-3'-phosphate cyclase  26.92 
 
 
338 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1948  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  36.23 
 
 
342 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.96 
 
 
350 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2542  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.65 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.615602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03223  hypothetical protein  32.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00131681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0294  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03271  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00246533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3895  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.56 
 
 
338 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3617  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3800  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.56 
 
 
338 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4728  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.47 
 
 
342 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0294  RNA 3'-phosphate cyclase  32.47 
 
 
338 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3700  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.84 
 
 
338 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0886189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1272  RNA-3'-phosphate cyclase  34.2 
 
 
355 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1665  RNA-3'-phosphate cyclase  35.28 
 
 
343 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0236  RNA 3'-phosphate cyclase  35.78 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3719  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.51 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3826  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  33.43 
 
 
353 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0680  RNA 3'-phosphate cyclase  31.83 
 
 
347 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3770  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  32.69 
 
 
348 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.47166  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4419  RNA 3'-phosphate cyclase  31.93 
 
 
345 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1692  RNA 3'-phosphate cyclase  33.79 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2495  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  35.29 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42732  predicted protein  31.03 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.672427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1474  RNA-3'-phosphate cyclase  33.06 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1143  RNA-3'-phosphate cyclase  33.33 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2180  RNA 3'-phosphate cyclase  33.25 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0499  RNA-3'-phosphate cyclase  30.45 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1676  RNA-3'-phosphate cyclase  34.45 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2128  RNA-3'-phosphate cyclase  31 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.364788  normal  0.0808055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2269  RNA 3'-phosphate cyclase  32.26 
 
 
371 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0625699  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07762  RNA 3'-terminal phosphate cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07640)  33.73 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056865 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03270  RNA-3'-phosphate cyclase, putative  25.7 
 
 
365 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22658  predicted protein  24.21 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35655  predicted protein  28.49 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.286653  normal  0.0571099 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33152  predicted protein  25.14 
 
 
365 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>