171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0212 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0212  putative aspartate racemase protein  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  44.54 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  42.04 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  42.04 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  36.52 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  34.78 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  34.84 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  33.48 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  32.61 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  33.18 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  35.68 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  35.24 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  35.68 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  33.91 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  34.84 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  32.73 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  33.04 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  32.73 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  33.91 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  32.73 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  32.73 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  33.19 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  33.03 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  33.03 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  32.27 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  31.74 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  33.92 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  33.48 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  35.29 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  31.96 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  31.74 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  31.74 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  31.74 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  33.04 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  33.04 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  33.48 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  32.61 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0557  aspartate racemase  33.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  32.16 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  32.89 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0560  aspartate racemase  33.78 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0477759  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  29.55 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  32.17 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  31.88 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  31.82 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  31.62 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  32.16 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  32.16 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  30.26 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  32.17 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  30.87 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  34.38 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  34.35 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  34.38 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0528  aspartate racemase  33.33 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  28.64 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  32.29 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  32.74 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  28.64 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  31.6 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  33.33 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  33.48 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  28.18 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  28.18 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  30.4 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  34.78 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  30.57 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  28.18 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  28.18 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6429  aspartate racemase  30.17 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.390115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  28.18 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  27.73 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  27.73 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  27.73 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  28.76 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  34.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  27.73 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  28.18 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  32.29 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  29.65 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  28.18 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  30.13 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  31.7 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  28.82 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0005  aspartate racemase  31.74 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  30 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  30.32 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  31 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  32.43 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3231  putative racemase  31.53 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000134766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1380  aspartate racemase  28.82 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  28.7 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  29.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>