183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1766 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0212  putative aspartate racemase protein  44.54 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  42.48 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  41.59 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  36.73 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  34.05 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  34.78 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  35.06 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  34.2 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  35.93 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  32.47 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  31.17 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  31.17 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  31.17 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  33.63 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  33.19 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  30.74 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  33.19 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  32.73 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  30.8 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  30.8 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  30.8 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  31.36 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  31.36 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  31.36 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1380  aspartate racemase  31.74 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  31.36 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  31.82 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  29.13 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  31.82 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  30.74 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  29.33 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0005  aspartate racemase  34.33 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  30.53 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  30.67 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  30.67 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  30.67 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  30.22 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1847  aspartate racemase  31.3 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.20632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  32.58 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  30.67 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  30.09 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  32.74 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  31.82 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  30.22 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  30.22 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  27.15 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  29.78 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  31.05 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  30.45 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  31.28 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  29.78 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  29.82 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  28.57 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  29.55 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  27.6 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  28.63 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  27.83 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  30.91 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  30 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  27.88 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  29.36 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  25.65 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  32.13 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  27.31 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  29.26 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  29.87 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  28.57 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  27.88 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  30.32 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  29.2 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  29.96 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  26.99 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  27.31 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0185  hypothetical protein  29 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  28.02 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  28.19 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2787  aspartate racemase  29.2 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  28.14 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  26.43 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  27.59 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  27.59 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  29 
 
 		 305 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  25.22 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  26.43 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  25.11 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3231  putative racemase  27.59 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000134766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  27.11 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3165  putative racemase  27.59 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3246  putative racemase  27.59 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000445722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  27.68 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  25.11 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3183  putative racemase  27.59 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  27.16 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>