23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0271 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  100 
 
 		 275 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  81.72 
 
 		 279 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  72.9 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  48.37 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  45.9 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  36.33 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  38.37 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  39.76 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  37.55 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  39.37 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  37.55 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  35.66 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  30.94 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  30.95 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  32.18 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  33.2 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  31.67 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  30.83 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  29.67 
 
 		 214 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  40.74 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  25.43 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  24.26 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>