13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3182 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  28.06 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  24.18 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  24.89 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  26.59 
 
 		 279 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  26.09 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  25.2 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  25.69 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  25.2 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  21.45 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  26.56 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  29.93 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  24.26 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>