23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0066 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  48.15 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  45.9 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  45.27 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  42.86 
 
 		 345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  37.69 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  34.96 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  37.45 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  34.41 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  29.82 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  34.41 
 
 		 406 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  34.41 
 
 		 406 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  32.97 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  34.82 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  33.74 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  32.23 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  33.75 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  31.82 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  28.27 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  32.83 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  28.06 
 
 		 363 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  23.41 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  25.29 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>