23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2175 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  74.62 
 
 		 279 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  72.9 
 
 		 275 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  49.4 
 
 		 345 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  48.15 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  39.09 
 
 		 407 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  38.46 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  39.38 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  38.46 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  38.82 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  35.1 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  35.51 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  31.28 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  32.64 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  34.16 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  35.1 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  32.74 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  39.24 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  26.2 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  26.59 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>