22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6873 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  100 
 
 		 285 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  97.19 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  38.87 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  37.65 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  39.76 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  38.82 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  35.57 
 
 		 325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  38.04 
 
 		 345 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  37.45 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  35.34 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  39.76 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  36.43 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  31.41 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  35.8 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  34 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  34 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  33.2 
 
 		 407 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  31.78 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  30.49 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31.03 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  29.31 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  25.69 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>