23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6250 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  97.19 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  38.87 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  37.7 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  39.38 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  39.13 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  37.69 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  35.97 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  37.65 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  34.94 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  39.37 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  35.69 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  32.13 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  34.31 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  35.2 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  34.14 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  35.2 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  31.62 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  30.94 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31.22 
 
 		 214 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  29 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  27.13 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>