22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4294 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  47.33 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  45.02 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  45.86 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  34.3 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  35.97 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  35.57 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  35.51 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  35.66 
 
 		 275 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  32.97 
 
 		 278 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  35.88 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  33.96 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  32 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  33.2 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  27.68 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  27.68 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  29.68 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  26.5 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  35.29 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  28.45 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  28.29 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  26.18 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>