21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5048 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  58.04 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  38.95 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  35.23 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  41.71 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  31.78 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  29.68 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  31.62 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  30.65 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  27.86 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  28.27 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  30.83 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  29.2 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  30.22 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  27.84 
 
 		 345 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  25.37 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  25.18 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  25.18 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  23.23 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3531  hypothetical protein  26.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  22.47 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>