16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4287 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  29.31 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  29 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  25.88 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  23.17 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  40.74 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  36.7 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  39.24 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  23.83 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  34.91 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  23.41 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  31.31 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  21.76 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  21.76 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  28.29 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  22.01 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>