23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4774 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  100 
 
 		 345 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  49.4 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  48.37 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  47.54 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  42.86 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  34.3 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  37.15 
 
 		 406 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  37.15 
 
 		 406 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  33.65 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  38.04 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  37.65 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  35.77 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  34.43 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  32.52 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  31.42 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  31.1 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  30.45 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  27.84 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  25.71 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  36.7 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  26.05 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  25.2 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>