21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6593 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  100 
 
 		 406 aa  842    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  79.37 
 
 		 407 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  100 
 
 		 406 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  42.62 
 
 		 299 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  38.68 
 
 		 279 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  37.15 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  37.55 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  37.55 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  34.41 
 
 		 278 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  35.2 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  34 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  27.68 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  27.83 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  27.09 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 325 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  29.85 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  24.49 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  25.18 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  30.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  21.76 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>