23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5038 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  44.87 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  38.95 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  38.35 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  42.38 
 
 		 214 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  35.54 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  34.31 
 
 		 285 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  35.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  35.61 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  33.2 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  35.1 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  33.2 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  33.33 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  33.75 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  29.85 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  29.85 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  28.7 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  27.83 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  25.97 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3531  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  25.2 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>