25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4470 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  100 
 
 		 337 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  55.03 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  45.02 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  45.86 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  36.33 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  34.96 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  35.34 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  34.94 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  35.1 
 
 		 279 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  35.77 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  33.96 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  35.54 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  32.67 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  31.64 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  27.09 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  27.09 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  27.86 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  26.48 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31 
 
 		 214 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  28.98 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  23.83 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0095  repFIB replication protein A  24.21 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0621039  hitchhiker  0.000000000993191 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0026  initiator RepB protein  24.21 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  21.45 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3078  hypothetical protein  23.45 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0904064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>