22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5045 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5045  TrfA  100 
 
 		 340 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4470  TrfA  55.03 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4294  hypothetical protein  45.02 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4399  hypothetical protein  45.49 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6250  TrfA family protein  37.7 
 
 		 285 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6873  TrfA family protein  37.65 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0066  TrfA-related protein  29.82 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4774  TrfA family protein  32.52 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0333  TrfA family protein  30.66 
 
 		 279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2175  trfA-related protein  31.28 
 
 		 279 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.839052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0271  TrfA family protein  30.94 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5038  hypothetical protein  35.61 
 
 		 288 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0930  hypothetical protein  27.65 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.304519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6499  TrfA  27.83 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0031681  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6593  TrfA family protein  27.83 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121098  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4277  TrfA family protein  28.62 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371968  normal  0.868321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2499  hypothetical protein  29.72 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5356  TrfA family protein  29.96 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0684  hypothetical protein  31.53 
 
 		 214 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.910515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5048  hypothetical protein  25.37 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4287  hypothetical protein  23.17 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3182  hypothetical protein  24.18 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>