More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0993 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0993  6-phosphofructokinase  100 
 
 
338 aa  684    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1343  6-phosphofructokinase  45.86 
 
 
333 aa  308  9e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1902  6-phosphofructokinase  44.71 
 
 
335 aa  292  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  38.48 
 
 
344 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  38.95 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  37.86 
 
 
373 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  37.94 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.86 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  37.5 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  37.93 
 
 
365 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  36.26 
 
 
341 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  36.84 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  37.13 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  38.01 
 
 
344 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  38.26 
 
 
364 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  36.47 
 
 
341 aa  215  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  35.8 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  37.13 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  36.55 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  35.88 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  37.24 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  38.3 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  39.05 
 
 
370 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  37.9 
 
 
341 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  38.86 
 
 
362 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  36.63 
 
 
345 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  36.34 
 
 
342 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  35.84 
 
 
341 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  37.95 
 
 
361 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  36.55 
 
 
341 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  37.9 
 
 
360 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  38.39 
 
 
363 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.02 
 
 
346 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  37.16 
 
 
359 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  34.56 
 
 
368 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  34.32 
 
 
351 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
363 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  34.8 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  41.03 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.8 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
340 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 
341 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.83 
 
 
370 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  36.1 
 
 
343 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  36.92 
 
 
363 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.06 
 
 
349 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  32.65 
 
 
339 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  36.75 
 
 
356 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  34.93 
 
 
359 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  34.2 
 
 
343 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  36.23 
 
 
372 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  32.94 
 
 
322 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  32.04 
 
 
323 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  35.65 
 
 
378 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  32.65 
 
 
331 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  32.84 
 
 
322 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  36.02 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 
324 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  34.21 
 
 
341 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  32.07 
 
 
320 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  33.13 
 
 
319 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  35.36 
 
 
372 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  38.49 
 
 
363 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  34.87 
 
 
365 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  31.86 
 
 
319 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  34.29 
 
 
366 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  32.54 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  34.58 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  32.36 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  34.14 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  32.63 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  34.3 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  34.11 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  31.95 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  30.9 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  31.68 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  34.7 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  32.54 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  32.65 
 
 
320 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  32.45 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  33.04 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  33.04 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>