More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1902 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1902  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 335 aa  678    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1343  6-phosphofructokinase  63.99 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0993  6-phosphofructokinase  44.71 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  39.31 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  39.17 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  40.18 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  40.3 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  37.61 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  37.61 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  37.61 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  37.54 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  38.01 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.3 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  38.22 
 
 		 360 aa  205  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.94 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  36.83 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  35.91 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  35.93 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  33.83 
 
 		 319 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  36.09 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  37.77 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  35.8 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  37.97 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  36.09 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  37.13 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  37.13 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  35.99 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  35.48 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  36.44 
 
 		 362 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  35.78 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.31 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  35.59 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  37.9 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  39.93 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  36.47 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  35.38 
 
 		 341 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  34.51 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  35.28 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  35.78 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  36.42 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  32.74 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  38.23 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  37.1 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  35.67 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.02 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  38.32 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  35.54 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  36.65 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  33.03 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  34.03 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  33.93 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  36.23 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  35.09 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  36.66 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  34.91 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.94 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  36.53 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  32.74 
 
 		 320 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  36.06 
 
 		 363 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  34.22 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>