35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3932 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  48.52 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  48.1 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  28.45 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  27.95 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  26.58 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  26.78 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  30.7 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  26.72 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  26.29 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  25.65 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  27.93 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.97 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  27.91 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  27.32 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  27.32 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  27.32 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  26.48 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  26.83 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  27.95 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  24.67 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  25.16 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  25.16 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  25.16 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  26.63 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  25.38 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  22.32 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  29.52 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  21.6 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>