28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4051 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  61.33 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  59.47 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  54.13 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  47.52 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  47.58 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  31.93 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  33.99 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  33.99 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  31.3 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  34.65 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  26.21 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  27.94 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  26.98 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  24.6 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  22.05 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  24.8 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  24.8 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  24.8 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  26.45 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  25.2 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  23.38 
 
 		 305 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>