19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3450 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  54.2 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  47.35 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  46.12 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  44.91 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  46.08 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  42.4 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  36.11 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  37.05 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  30.93 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  32.33 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  27.57 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  25.53 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  25.31 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  24.54 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  24.54 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  24.54 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  24.54 
 
 		 267 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>