16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3155 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  54.2 
 
 
237 aa  251  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  50.41 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  47.33 
 
 
242 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  50.22 
 
 
240 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  45.69 
 
 
236 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  45.26 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  35.41 
 
 
251 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  35.02 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  31.49 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  36.19 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  32.92 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  28.74 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  23.61 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  24.24 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  25.2 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>