22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0383 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  98.41 
 
 		 251 aa  493  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  88.45 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  45.92 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  34.52 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  36.69 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  35.02 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  35.41 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  33.47 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  35.39 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  27.94 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  29.9 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  23.4 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  23.16 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  23.16 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  23.16 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  23.16 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  23.9 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  23.9 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  23.9 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  24.32 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>