33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0558 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  29.53 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  30.4 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  30.29 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  27.57 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  26.36 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  28.99 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  26.89 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  25.3 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  25.63 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  26.74 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  27.44 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  26.47 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  24 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  21.78 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  21.78 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  24.36 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  24.06 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  25.49 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  25.49 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  25.49 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  27.92 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  21.46 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  27.97 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  22.93 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  31.07 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>