15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4111 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  60 
 
 
236 aa  287  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  56.61 
 
 
242 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  60.54 
 
 
240 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  53.1 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  50.41 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  47.35 
 
 
237 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  34.13 
 
 
251 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  34.13 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  31.93 
 
 
244 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  31.17 
 
 
251 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  25.3 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  23.16 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  23.26 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>