17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0492 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  88.45 
 
 		 251 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  88.84 
 
 		 251 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  44.64 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  35.27 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  36.58 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  35.66 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  34.29 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  28.87 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  22.94 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  23.79 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  23.43 
 
 		 249 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  25.44 
 
 		 247 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>