14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0606 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0606  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  59.47 
 
 
236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4111  hypothetical protein  53.81 
 
 
235 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2640  hypothetical protein  57.46 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698149  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  48.15 
 
 
242 aa  228  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3155  hypothetical protein  46.69 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.010692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  43.61 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  35.97 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  35.97 
 
 
251 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0651  hypothetical protein  29.83 
 
 
244 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000628149  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0492  hypothetical protein  34.36 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  29.44 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  29.12 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  24.77 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>