19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  90.38 
 
 		 239 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  47.72 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  25.35 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  25.4 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  26.03 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  22.84 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  24.76 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  22.41 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  21.76 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  21.62 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  25.16 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  25.84 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>