32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1016 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  54.1 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  53.41 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  54.87 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  46.73 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  48.69 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  48.69 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  48.69 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  48.69 
 
 		 267 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  45.75 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  44.26 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  48.04 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  43.73 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  32.64 
 
 		 201 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  33.65 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  27 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  27.92 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  28.47 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  28.43 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  31.36 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  28.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  27.15 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  24.76 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  27.4 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  23.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>