31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2816 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  57.03 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  49.61 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  48.63 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  48.63 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  48.63 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  48.63 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  48.05 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  46.88 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  50.19 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 305 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  46.88 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  45.8 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  44.35 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  35.8 
 
 		 201 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  30.26 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  28.47 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  28.99 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  29.03 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  29.08 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  27.83 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  24.89 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  25.45 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  26.32 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  25.88 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  25.23 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  26.25 
 
 		 249 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>